| Panel name | NGS Hereditary cancer panel 2 |
|---|---|
| Panel method | WES-based NGS |
| Panel version ** | v7.1 |
| Panel quality *** | |
| Core-NL | No core-NL genes included |
| CNV analysis | No |
| Note | Coverage gegevens volgen nog. |
| Location | Location VUmc |
| Genes (155) | Quality | % coverage >30 | % coverage >20 | Core-NL | Note |
|---|---|---|---|---|---|
| ABRAXAS1 | |||||
| ACD | |||||
| AIP | |||||
| AKT1 | |||||
| ALK | |||||
| ANKRD26 | |||||
| APC | |||||
| ATM | |||||
| AXIN2 | |||||
| BAP1 | |||||
| BARD1 | |||||
| BLM | |||||
| BMPR1A | |||||
| BRCA1 | |||||
| BRCA2 | |||||
| BRIP1 | |||||
| BUB1B | |||||
| BUB3 | |||||
| CBL | |||||
| CDC73 | |||||
| CDH1 | |||||
| CDK4 | |||||
| CDKN1A | |||||
| CDKN1B | |||||
| CDKN1C | |||||
| CDKN2A | |||||
| CDKN2B | |||||
| CDKN2C | |||||
| CEBPA | |||||
| CHEK2 | |||||
| CTC1 | |||||
| CTNNA1 | |||||
| CTR9 | |||||
| CYLD | |||||
| DDB2 | |||||
| DDX41 | |||||
| DICER1 | |||||
| DIS3L2 | |||||
| DKC1 | |||||
| DOCK8 | |||||
| EGFR | |||||
| EPCAM | |||||
| ERCC2 | |||||
| ERCC3 | |||||
| ERCC4 | |||||
| ERCC5 | |||||
| ETV6 | |||||
| EXT1 | |||||
| EXT2 | |||||
| FAAP100 | |||||
| FAH | |||||
| FAN1 | |||||
| FANCA | |||||
| FANCB | |||||
| FANCC | |||||
| FANCD2 | |||||
| FANCE | |||||
| FANCF | |||||
| FANCG | |||||
| FANCI | |||||
| FANCL | |||||
| FANCM | |||||
| FAS | |||||
| FH | |||||
| FLCN | |||||
| GALNT12 | |||||
| GATA2 | |||||
| GPC3 | |||||
| GREM1 | |||||
| HMBS | |||||
| HOXB13 | |||||
| IPMK | |||||
| ITK | |||||
| KIT | |||||
| LZTR1 | |||||
| MAD2L2 | |||||
| MAX | |||||
| MBD4 | |||||
| MCM9 | |||||
| MEN1 | |||||
| MET | |||||
| MITF | |||||
| MLH1 | |||||
| MLH3 | |||||
| MSH2 | |||||
| MSH3 | |||||
| MSH6 | |||||
| MTAP | |||||
| MUTYH | |||||
| NBN | |||||
| NF1 | |||||
| NF2 | |||||
| NSD1 | |||||
| NTHL1 | |||||
| PALB2 | |||||
| PAX5 | |||||
| PDGFRA | |||||
| PHOX2B | |||||
| PIK3CA | |||||
| PMS2 | |||||
| POLD1 | |||||
| POLE | |||||
| POLH | |||||
| POT1 | |||||
| PRDM10 | |||||
| PRF1 | |||||
| PRKAR1A | |||||
| PTCH1 | |||||
| PTCH2 | |||||
| PTEN | |||||
| PTPN11 | |||||
| RAD50 | |||||
| RAD51 | |||||
| RAD51C | |||||
| RAD51D | |||||
| RB1 | |||||
| RECQL4 | |||||
| REST | |||||
| RET | |||||
| RHBDF2 | |||||
| RMRP | |||||
| RNF139 | |||||
| RNF43 | |||||
| RUNX1 | |||||
| SBDS | |||||
| SDHA | |||||
| SDHAF2 | |||||
| SDHB | |||||
| SDHC | |||||
| SDHD | |||||
| SH2D1A | |||||
| SLX4 | |||||
| SMAD4 | |||||
| SMARCA4 | |||||
| SMARCB1 | |||||
| SMARCE1 | |||||
| SOS1 | |||||
| SPRED1 | |||||
| STK11 | |||||
| SUFU | |||||
| TERF2IP | |||||
| TERT | |||||
| TMEM127 | |||||
| TP53 | |||||
| TRIM37 | |||||
| TRIP13 | |||||
| TSC1 | |||||
| TSC2 | |||||
| VHL | |||||
| WAS | |||||
| WRN | |||||
| WT1 | |||||
| XPA | |||||
| XPC | |||||
| XRCC2 |
| Indication(s) |
|---|
| Oncogenetics |
** For information on previous versions of this panel, please contact the Genome Diagnostics Laboratory
*** NGS panel genes can be analyzed with different quality. More info about test quality type A, C or A/C